Los no vacunados están muriendo de COVID-19

En los EE. UU., más de 853,000 personas fueron hospitalizadas por COVID-19 en mayo de 2021.¹ Aproximadamente el 0.1% (menos de 1,200) de ellas estaban completamente vacunadas. De las 18,000 muertes por COVID-19 en mayo, solo 150 (0.8%) fueron personas que estaban completamente vacunadas.¹ Mientras tanto, la variante Delta, más transmisible del virus SARS-CoV-2, se ha detectado en al menos 98 países.² La Organización Mundial de la Salud (OMS) la designó como variante de preocupación (VOC) el 11 de mayo de 2021.³ Se ha convertido en la cepa dominante en India, Bangladesh, Reino Unido, EE. UU., Singapur, Rusia, Indonesia, Portugal, Luxemburgo, los Países Bajos, Dinamarca, Sudáfrica y Australia.^{3, 4} Los objetivos del artículo de este mes son describir las VOC y las variantes de interés (VOI), así como la evolución del virus SARS-CoV-2.

Variantes de preocupación (variants of concern, VOC) y variantes de interés (variants of interest, VOI)

La OMS define una VOC como una variante que se ha demostrado que está asociada con uno o más de los siguientes cambios:³

Aumento de la transmisibilidad o cambio perjudicial en la epidemiología de COVID-19; o
Aumento de la virulencia o cambio en la presentación clínica de la enfermedad; o
Disminución de la eficacia de las medidas sociales y de salud pública o de los diagnósticos, vacunas y terapéuticas disponibles.

La OMS ha designado variantes Alfa, Beta, Gamma y Delta como VOC. Sus linajes evolutivos están definidos por Asignación Filogenética de Linajes de Brote Global Nombrados, también conocido como Pango.^5-7 Es una herramienta de software. Su propósito es implementar una nomenclatura dinámica para clasificar los linajes genéticos del SARS-CoV-2.⁸ Un usuario con una secuencia de genoma completa de un genoma de SARS-CoV-2 puede usar la herramienta para enviar esa secuencia. Luego se compara con otras secuencias del genoma y se le asigna el linaje más probable.⁸

Variantes

También hay algunas variantes de Epsilon que la OMS ha designado como VOI. Una VOI es una variante que, si se compara con una variante de referencia, presenta importantes mutaciones en su genoma. Estas mutaciones tienen implicaciones establecidas o sospechadas sobre el fenotipo. Las VOI también causan la transmisión comunitaria del virus con múltiples casos o grupos de COVID-19, o se han detectado en varios países. Una VOI también puede ser designada como VOI por el Grupo de Trabajo de Evolución del Virus del SARS-CoV-2 de la OMS.

Los Centros para el Control de Enfermedades (CDC) de EE. UU. tienen definiciones ligeramente diferentes.⁹ Para ellos, una VOC es una variante para la que hay evidencia de un aumento de la transmisibilidad, una enfermedad más grave (por ejemplo, un aumento de las hospitalizaciones o muertes), una reducción significativa de la neutralización por los anticuerpos generados durante una infección o vacunación previa, una reducción de la eficacia de los tratamientos o vacunas o fallas en la detección de diagnóstico. Las variantes B.1.1.7 (Alpha), B.1.351 (Beta), P.1 (Gamma), B.1.427 (Epsilon), B.1.429 (Epsilon) y B.1.617.2 (Delta) que circulan en los Estados Unidos se clasifican como variantes preocupantes. Tienen las siguientes mutaciones en la parte de su genoma que codifica la proteína pica.

B.1.1.7 (Alpha) Sustituciones de proteínas de pico: 69del, 70del, 144del, (E484K), (S494P), N501Y, A570D, D614G, P681H, T716I, S982A, D1118H (K1191N).
B.1.351 (Beta) Sustituciones de proteínas de pico: D80A, D215G, 241del, 242del, 243del, K417N, E484K, N501Y, D614G, A701V.
P.1 (Gamma) Sustituciones de proteínas de pico: L18F, T20N, P26S, D138Y, R190S, K417T, E484K, N501Y, D614G, H655Y, T1027I.
B.1.617.2 (Delta) Sustituciones de proteínas de pico: T19R, (G142D), 156del, 157del, R158G, L452R, T478K, D614G, P681R, D950N.
B.1.427 (Epsilon) Sustituciones de proteínas de pico: L452R, D614G.
B.1.429 (Epsilon) Sustituciones de proteínas de pico: S13I, W152C, L452R, D614G.

Las abreviaturas de una letra para los aminoácidos se enumeran en el Apéndice. La primera mutación muy significativa fue en el aminoácido 614. El virus original tenía un D-aspartato (D) en esta posición. Un mutante surgió temprano en el que 614 es una glicina (G). Esto se llama mutación D614G. Esta mutación en la proteína S la hizo más estable y el virus más infeccioso. Se convirtió en la variante dominante a medida que se extendía a América. En la variante Beta de Sudáfrica, apareció una mutación K417N (lisina a asparagina) de forma independiente en los EE. UU. y en varios países europeos. Esta mutación se asocia con el escape de la neutralización por anticuerpos monoclonales y policlonales en el suero sanguíneo.¹ También tiene mutaciones E484K y N501Y. La variante P.1 Gamma tiene mutaciones K417T, E484K y N501Y.

También hay una Delta Plus, una variante que tiene una mutación K417N. También se conoce como AY.1.

Hay otras dos variantes denominadas B.1.427 y B.1.429 que son bastante preocupantes, aunque todavía no se han designado como VOC.¹² Un estudio reciente en Suiza probó la capacidad del plasma sanguíneo para neutralizar un pseudovirus elaborado utilizando la proteína pico de las variantes B.1.427 y B.1.429 del virus SARS-CoV-2. Esto se comparó con la capacidad del plasma para neutralizar la variante de tipo salvaje que tenía la mutación D614G. Analizaron el plasma de once personas que recibieron dos dosis de la vacuna Moderna y de catorce personas que recibieron dos dosis de la vacuna Pfizer-BioNtech. Se extrajo plasma sanguíneo entre 7 y 27 días después de recibir la segunda inyección. Todas las vacunas tenían una actividad neutralizante del plasma sustancial contra los pseudovirus del SARS-CoV-2 de tipo salvaje. La potencia de neutralización promedio del plasma de las personas que recibieron la vacuna Moderna se redujo 2.8 veces para las variantes B.1.427 y B.1.429 S, y se redujo 4 veces en las personas que recibieron la vacuna Pfizer-BioNtech.¹² Queda por ver si esta potencia reducida en el laboratorio también se verá en las personas. En Escocia, las vacunas Oxford-AstraZeneca y Pfizer-BioNTech contra la COVID-19 fueron efectivas para reducir el riesgo de infección por SARS-CoV-2 y hospitalización por COVID-19 en personas con VOC Delta.¹³ La VOC Delta en Escocia se encontró principalmente en grupos más jóvenes y ricos. El riesgo de ingreso hospitalario por COVID-19 se duplicó aproximadamente en aquellos con el VOC Delta en comparación con el VOC Alfa, y el riesgo de ingreso aumentó particularmente en aquellos con cinco o más comorbilidades relevantes. Las vacunas Oxford-AstraZeneca y Pfizer-BioNTech contra la COVID-19 fueron eficaces para reducir el riesgo de infección por SARS-CoV-2 y la hospitalización por COVID-19 en personas con VOC Delta.¹³ Por otro lado, datos recientes de Israel muestran que ha habido una disminución en la eficacia de la vacuna Pfizer-BioNTech a medida que se propaga la variante Delta.¹⁴ Entre el 2 de mayo y el 5 de junio, la vacuna tuvo una tasa de eficacia del 94.3%. El 6 de junio (cinco días después de que el gobierno canceló las restricciones sociales) hasta principios de julio, la tasa disminuyó al 64%. Se registró una disminución similar en la protección contra los síntomas de COVID-19. Al mismo tiempo, la protección contra la hospitalización y las enfermedades graves siguió siendo sólida. Del 2 de mayo al 5 de junio, la tasa de eficacia en la prevención de la hospitalización fue del 98.2%, en comparación con el 93% del del 6 de junio al 3 de julio.¹⁴

Aun así, el virus continúa mutando, produciendo nuevas variantes.¹⁵ Las personas no vacunadas proporcionan al virus un ecosistema en sus cuerpos que continuará produciendo variantes más transmisibles.

La evolución del virus SARS-CoV-2

Debido a la falta de financiación, los virólogos solo han podido identificar una fracción muy pequeña de los virus que existen en la Tierra. Se ha estimado que hay más de medio millón de virus no identificados.¹⁶ Todo lo que se puede hacer es intentar encontrar el genoma viral en las bases de datos existentes que más se asemeje al de la variante original del virus SARS-CoV-2 que se vio en Wuhan, China en diciembre de 2019. Sin embargo, este coronavirus casi ciertamente existió antes de que infectara y matara a suficientes personas como para ser notado. Hasta que ocurrió el brote en Wuhan, nadie estaba mirando de cerca todas las bases de datos.

Por lo tanto, hay un conjunto de datos que contiene secuencias de SARS-CoV-2 de principios de la epidemia de Wuhan que se eliminó del Archivo de lectura de secuencias de los NIH.¹⁷ Se encontró y se recuperó de algunos archivos eliminados en Google Cloud. El investigador reconstruyó secuencias parciales de trece versiones tempranas de los coronavirus. El análisis filogenético de estas secuencias sugiere que las secuencias del mercado de mariscos de Hunan que son el foco del informe conjunto OMS-China no son completamente representativas de los virus en la epidemia. En cambio, el progenitor de secuencias conocidas de SARS-CoV-2 probablemente contenía tres mutaciones que lo hacían más similar a los parientes del coronavirus de murciélago. Los genomas de la matriz actual de variantes son consistentes con la expansión de una secuencia variante progenitora única. Sin embargo, los intentos de identificar a este progenitor se han visto confundidos por una observación desconcertante: las primeras secuencias informadas de Wuhan no son las secuencias más similares a los parientes del coronavirus de murciélago del SARS-CoV-2. Se analizaron las secuencias eliminadas y ahora parciales de SARS-CoV-2 de la primera epidemia de Wuhan. Esto llevó a algunas conclusiones. En primer lugar, las secuencias del mercado de productos del mar de Hunan que fueron el foco del informe conjunto OMS-China pueden no ser representativas de todas las variantes que estaban presentes al principio de la epidemia. Los datos eliminados, así como las secuencias existentes de pacientes infectados por Wuhan hospitalizados en Guangdong, muestran que las secuencias tempranas de Wuhan a menudo contenían una mutación de timina a citosina en la base número 29095 (T29095C) y era menos probable que contuvieran dos bases que están en secuencias enumeradas en el informe conjunto OMS-China. En segundo lugar, hay dos identidades plausibles para el progenitor de todas las variantes conocidas del SARS-CoV-2. Una de ellas fue descrita por Kumar y colaboradores,¹⁷ y la otra es una secuencia que porta tres mutaciones (C8782T, T28144C y C29095T) en relación con Wuhan-Hu-1.¹⁷ Independientemente de qué coronavirus fue el progenitor del virus SARS-CoV-2, la evolución ha continuado. Así como no sabemos lo suficiente o no tenemos suficientes datos para identificar al verdadero progenitor, tampoco podemos predecir dónde y cuándo surgirá la siguiente variante más transmisible y mortal.

Los niños están relativamente seguros hasta ahora. En los EE. UU., solo alrededor del 1.7% de todas las personas que han dado positivo en la prueba del virus del SARS-CoV son niños menores de 18 años (1.1% en los Países Bajos y 2.0% en el Reino Unido).¹⁸ Al 7 de abril de 2021, solo el 0.0167% de todas las muertes por COVID-19 en los EE. UU. estaban en el grupo de edad de 0 a 4 años, a pesar de ser aproximadamente el 6% de la población total.^{19, 20}

Aun así, hay efectos persistentes en algunos. Sin embargo, son los ancianos no vacunados los que corren mayor riesgo. Es posible que algunos padres no quieran vacunar a sus hijos simplemente para proteger a las personas mayores que son demasiado tercas para vacunarse. Sin embargo, es cierto que algunos niños pequeños sufrirán de una forma u otra si no se vacunan suficientes adultos. Curiosamente, recientemente en Fox News alguien presentó una breve charla que alentó a las personas a vacunar a los niños pequeños.²¹ Esta es la misma Fox News que difunde las mentiras de Donald Trump y el Partido Republicano y niega el cambio climático global. Tienen una larga historia de poner en peligro la vida de innumerables niños pequeños. Por tanto, es curioso que animen a los adultos a no vacunarse, pero sí a vacunar a los niños pequeños. Se están llevando a cabo ensayos clínicos en niños desde los seis meses de edad. Los resultados probablemente estarán disponibles este otoño.

Apéndice

Abreviaturas de aminoácidos: A-alanina; C-cisteína; D-ácido aspártico; E-ácido glutámico; F-fenilalanina; G-glicina; H-histidina; I-isoleucina; K-lisina; L-leucina; M-metionina; N-asparagina; P-prolina; Q-glutamina; R-arginina; S-serina; T-treonina; V-valina; W-triptófano; Y-tirosina.

Entonces, D614G es cuando una mutación cambia un ácido aspártico (D) se convierte en una glicina (G), N501Y es cuando una mutación cambia una asparagina (N) en una tirosina (Y); L452R es cuando una mutación cambia una leucina (L) en una arginina (R); K417N es cuando una mutación cambia una lisina (K) en una arginina (R); P681R es cuando una mutación cambia una prolina (P) en una arginina (R).