La Colección de Arte Virreinal y Siglo XIX está conformada por obras realizadas durante el período novohispano (1521-1821) y el México Independiente (hasta 1900). Esta colección permite distinguir diferentes momentos de la vida de las obras, la creación de las piezas, la forma en que fueron usadas y a veces veneradas, así como las funciones adquiridas en nuevos entornos.
Se han reunido piezas de muy variadas técnicas, como un muestrario de la diversidad artística de nuestro país en estos períodos históricos. En pintura hay óleos sobre tela, placas de cobre y estaño; en la escultura, obras de madera, algunas con decoraciones estofadas, además de repicados y otro tipo de ornamentaciones. En los muebles también se usaron técnicas diversas, y aunque la madera es su principal material se combina con cueros (a veces grabados y pintados), así como con sedas y terciopelos para sillas y sillones. En baúles, arcones, escribanías y cajones se presentan materiales complementarios o de ornato como marfiles, metales u otras maderas de distintas apariencias y pintura.
El recorrido por las salas permite asomarse a los espacios del pasado y apreciar, desde una mirada actual, las pinturas, esculturas, muebles y artes útiles que se conjugan para crear una vivencia vinculada al aire familiar e íntimo de una casona del siglo XIX.